2013年12月30日，环保部对外通报了2013年开展环保专项行动医药制造企业督查情况，点名18家涉嫌环境违法问题的医药企业，并予以挂牌督办，其中包括鲁抗医药。

　　环保部当时透露，鲁抗医药存在兽药生产线未经竣工环保验收擅自投产，卫生防护距离内居民未拆迁到位，未按环评要求建成项目需要配套的废水处理设施，精馏残渣等危险废物去向不明等问题。

　　经鲁抗医药核实，其位于济宁邹城工业园区的子公司——山东鲁抗生物制造有限公司存在未履行环保“三同时”验收、建设项目擅自投入试生产和违反危险废物污染环境防治有关规定。为此，邹城市环保局对其处以3万元罚款。

　　今年1月3日，鲁抗医药发布公告称，已采取多项整改措施，包括停止兽药生产线的试生产、在当地政府协调下搬离卫生防护距离内的居民、将危废物委托给有资质的单位统一处理等。

　　此外，更早些时候，鲁抗还被通报过其他问题，包括胶囊铬超标、发布违规医疗广告等。